Игра разрабатывается на движке Anvil, благодаря которому, были добавлены более качественные эффекты и проработаны детали в графике. Появились также некоторые нововведения в виде смены дня и ночи (которых не было в первой части) и новая система смены одеяний персонажей. Ну и конечно же, новая часть может похвастаться более проработанной графикой внешнего, открытого мира и улучшенной технологией освещения и отражения.
В игре стали доступны Секретные локации. Они представляют собой несколько знаменитых достопримечательностей Италии. Вход в них можно обнаружить в самых разных местах в игре. Эти локации проверят игроков на их реакцию, стелс, логику и акробатику.
В Assassin’s Creed 2, Эцио сможет управлять повозкой, запряженной лошадьми, когда будет путешествовать по пригороду. Это позволит ему быстрее добираться до нового пункта назначения, а также, он сможет сопровождать некоторых персонажей в повозке.
Появилась система апгрейда брони, так что Эцио сможет улучшать разные части своего одеяния — наплечники, нагрудники, сапоги и многое другое. Каждый вид брони будет обладать своими характеристиками, которые не только добавят Эцио повышенную защиту, но и немного поменяют его внешний вид.
Эцио получит от Леонардо да Винчи, отравленный клинок, который представляет собой иглу, прикрепленную к кисти руки. Благодаря этому, Эцио может скрыто убивать врагов. Чтобы «перезарядить» иглу, надо будет найти лекаря, который продаст Эцио яд. Также можно будет подлечить раны Эцио, если его задели во время стычки.